В Калининградской области ежедневно до 10 торговых судов различного водоизмещения и назначения осуществляет перевозку по Калининградскому морскому каналу товаров, находящихся под таможенным контролем.
Основными видами перевозимых грузов, как правило, являются нефтепродукты, черные и цветные металлы, металлолом, зерновые культуры, рыба и рыбопродукты, щебень, песок и другие строительные материалы.
Таможенное оформление судов на вход и выход производится таможенными постами Калининградской областной таможни Морской порт Калининград им. Н.С. Хазова, Балтийск и Светлый.
Кроме этого, через Калининградский залив еженедельно осуществляется до двух рейсов буксируемых барж, следующих из Калининграда в порт Фромборк Польши с грузом каменного угля, а обратно — с грузами стройматериалов.
Плюс к этому, в Калининградском заливе ежедневно ведут промысел водных биологических ресурсов рыболовные суда.
Для предупреждения и пресечения нарушений таможенного законодательства на всей акватории в зоне ответственности Калининградской областной таможни несут службу таможенные суда. Они действуют совместно с береговыми оперативно-подвижными группами, сформированными из сотрудников оперативно-розыскного отдела таможни, специального отряда быстрого реагирования, должностных лиц таможенных постов, расположенных в портах и портопунктах. Взаимодействие осуществляется и с сотрудниками подразделений ГМИ ПУ ФСБ России по Калининградской области, ГИМС МЧС России по Калининградской области и Федерального агентства по рыболовству Западно-Балтийского территориального управления. Таможенные суда регулярно патрулируют таможенную границу, осуществляют таможенный контроль и таможенное наблюдение за перемещением и дислокацией судов, а также контроль за поддержанием режима зон таможенного контроля, расположенных в портах и портопунктах в зоне ответственности таможни.
Так, в 2013 году проконтролировано 356 российских и иностранных судов в порту Калининград им. Хазова, портопунктах Светлый, Балтийск, акваториях Калининградского морского канала, Куршского и Калининградского заливов, осуществлено таможенное наблюдение за 248 судами в Балтийском море и 5684 судами на рейде и акватории порта Пионерский. Всего в прошлом году таможенные суда находились на службе 395 суток.
В минувшем году малое таможенное судно «ТС-597» приняло участие в двухнедельной специальной операции «Щит-2» на озере Выштынецкое совместно с сотрудниками СОБР и подразделениями Федеральной пограничной службы России. В ходе мероприятия были отработаны оперативная транспортировка судна автотранспортом из пункта постоянного базирования в городе Советск на озеро Выштынецкое, мероприятия по базированию и охраны судна на причале пограничной заставы, определены места базирования и возможного спуска судна на воду с необорудованного побережья, изучена акватория озера, определены места возможных подъездов к берегу транспортных средств с контрабандой, изучена оперативная обстановка. Ежедневно патрулировалась акватория озера Выштынецкое для охраны экономической границы Российской Федерации.
В ходе спецопераций «Щит-2» и «Щит-3», проводимых летом 2013 года во взаимодействии с сотрудниками таможенного СОБРа и сотрудниками ПУ ФСБ РФ по Калининградской области, экипажами судов при попытке незаконного перемещения гражданами РФ на территорию Литовской Республики задержано несколько десятков тысяч пачек сигарет «Джин Линг» общей стоимостью около миллиона рублей.
Также в 2013 году большое таможенное судно «Дмитрий Шишков» совместно с кораблями и катерами ПС ФСБ России, судами ГИМС и ГОСАКВОСПАСа МЧС России по Калининградской области участвовало в бассейновых учениях в Балтийском море по спасанию людей, терпящих бедствие.
После начала навигации 2014 года таможенными судами Калининградской областной таможни осуществлено более 70 выходов, во время которых проведен контроль за соблюдением режима зоны таможенного контроля, произведено таможенное наблюдение за перевозкой товаров, находящихся под таможенным контролем, совершением с ними грузовых и иных операций в отношении 250 судов. Малое таможенное судно «ТС-597» в период с 12 мая по 31 июля участвует в специальной операции «Щит-4» совместно с правоохранительным блоком таможни на озере Виштынецкое.
По результатам совместных действий по контролю за акваторией удаленного терминала Пионерский с экипажем БТС «Дмитрий Шишков» в феврале 2014 года составлено 2 протокола о нарушении таможенных правил по ст. 16.5 «Нарушение режима зоны таможенного контроля» КоАП РФ.
В апреле при патрулирования акватории порта Калининград экипажами малых таможенных судов «ТС-598» и «ТС-524» совместно с должностными лицами таможенного поста Морской порт Калининград им. Н.С. Хазова и сотрудниками СОБР проведены первичные мероприятия по фиксации административных правонарушений по ст. 16.24 КоАП РФ «Незаконное распоряжение транспортным средством международной перевозки» и ст. 16.13 КоАП РФ «Разгрузка, погрузка, выгрузка, перегрузка (перевалка) и иные грузовые операции без разрешения таможенного органа». По итогам проверочных мероприятий будет приниматься решение о возбуждении дел об административных правонарушениях.
На сегодняшний день в распоряжении Калининградской областной таможни находится 7 судов: БТС «Дмитрий Шишков», 2 средних и 4 малых ТС.